1. | Наименование проекта | Оценка риска распространения древних инфекционных агентов на основе комплексных палеомикробиологических исследований археологических и палеонтологических находок, сделанных в Арктической зоне Российской Федерации |
---|---|---|
2. | Регистрационный номер ЦИТИС: | АААА-А18-118052990079-7 |
3. | Исполнитель | Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова |
4. | Ведомственная принадлежность | Минздрав России |
5. | Заказчик | Минздрав России |
6. | Вид финансирования | ГЗ |
7. | Вид НИОКТР | Прикладная НИР |
8. | Приоритетное направление (основное) | Науки о жизни |
9. | Приоритетное направление (дополнительное) | Нет данных |
10. | Критическая технология (основная) | Геномные, протеомные и постгеномные технологии |
11. | Критическая технология (дополнительная) | Нет данных |
12. | Приоритет Стратегии НТР России | |
13. | Общее тематическое направление | |
14. | Приоритетное арктическое направление (основное) | |
15. | Приоритетное арктическое направление (дополнительное) | |
16. | Аннотация | Большую опасность может представлять возвращение в экосистемы возбудителей особо опасных инфекций XVIII–XIX веков вследствие оттаивания многолетней мерзлоты в местах захоронений погибших от них людей, а также палеомикроорганизмов, содержащихся в останках мамонтовой фауны в слое многолетнемерзлых грунтов. Результаты исследований показывают, что в условиях вечной мерзлоты в тканях умерших от оспы людей могут сохраняться жизнеспособные вирусы. Об этом говорит и изучение штаммов вируса, хранившихся в течение 26 лет в Национальной коллекции страны и оказавшихся жизнемпомобными. В последние годы риск распространения патогенного генетического материала из могильников, размещенных в зоне современного оттаивания вечной мерзлоты приобретает реальный, а не гипотетический характер. Таким образом, необходимость комплексной оценки риска, связанного с распространением древних штаммов микроорганизмов или их ДНК в современных природных экосистемах, в том числе в зонах таяния вечномерзлых почв представляется обоснованной, своевременной и целесообразной. Цель исследования: определение таксономического состава и биологических свойств патогенной микробиоты идентифицируемой в палеонтологическом и археологическом материале культуральными методами и методами метагеномного анализа. Оценка биологических свойств культивируемых и некультивируемых микроорганизмов включит в себя поиск генетических детерминант патогенности, а также генетических структур, которые могут быть использованы для калибровки «молекулярных часов» при изучении эволюции актуальных возбудителей инфекционных заболеваний. В результате выполнения проекта впервые предполагается получить информацию относительно распространенности возбудителей инфекционных заболеваний в останках коренного населения Западной Сибири, жившего в различные временные периоды начиная с XII века, а также о структуре микробных сообществ мерзлых мумий представителей мамонтовой фауны, включая наличие культивируемых потенциально патогенных бактерий. На основании анализа последовательностей генов «хромосомного ядра» и мобильных генов будет получена информация о направлении и скорости эволюции геномов разнообразных групп патогенных микроорганизмов, осуществлен поиск представителей ранее неохарактеризованных эволюционных линий. Полученные данные могут быть использованы при реконструкции эволюционной истории и филогеографии возбудителей инфекционных заболеваний, включая возбудителей инфекций, отнесенных к числу особо опасных. |
17. | Начало проекта | 01.01.2018 |
18. | Завершение проекта | 31.12.2020 |