Информация о проекте

1. Наименование проекта Оценка риска распространения древних инфекционных агентов на основе комплексных палеомикробиологических исследований археологических и палеонтологических находок, сделанных в Арктической зоне Российской Федерации
2. Регистрационный номер ЦИТИС: АААА-А18-118052990079-7
3. Исполнитель Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова
4. Ведомственная принадлежность Минздрав России
5. Заказчик Минздрав России
6. Вид финансирования ГЗ
7. Вид НИОКТР Прикладная НИР
8. Приоритетное направление (основное) Науки о жизни
9. Приоритетное направление (дополнительное) Нет данных
10. Критическая технология (основная) Геномные, протеомные и постгеномные технологии
11. Критическая технология (дополнительная) Нет данных
12. Приоритет Стратегии НТР России
13. Общее тематическое направление
14. Приоритетное арктическое направление (основное)
15. Приоритетное арктическое направление (дополнительное)
16. Аннотация Большую опасность может представлять возвращение в экосистемы возбудителей особо опасных инфекций XVIII–XIX веков вследствие оттаивания многолетней мерзлоты в местах захоронений погибших от них людей, а также палеомикроорганизмов, содержащихся в останках мамонтовой фауны в слое многолетнемерзлых грунтов. Результаты исследований показывают, что в условиях вечной мерзлоты в тканях умерших от оспы людей могут сохраняться жизнеспособные вирусы. Об этом говорит и изучение штаммов вируса, хранившихся в течение 26 лет в Национальной коллекции страны и оказавшихся жизнемпомобными. В последние годы риск распространения патогенного генетического материала из могильников, размещенных в зоне современного оттаивания вечной мерзлоты приобретает реальный, а не гипотетический характер. Таким образом, необходимость комплексной оценки риска, связанного с распространением древних штаммов микроорганизмов или их ДНК в современных природных экосистемах, в том числе в зонах таяния вечномерзлых почв представляется обоснованной, своевременной и целесообразной. Цель исследования: определение таксономического состава и биологических свойств патогенной микробиоты идентифицируемой в палеонтологическом и археологическом материале культуральными методами и методами метагеномного анализа. Оценка биологических свойств культивируемых и некультивируемых микроорганизмов включит в себя поиск генетических детерминант патогенности, а также генетических структур, которые могут быть использованы для калибровки «молекулярных часов» при изучении эволюции актуальных возбудителей инфекционных заболеваний. В результате выполнения проекта впервые предполагается получить информацию относительно распространенности возбудителей инфекционных заболеваний в останках коренного населения Западной Сибири, жившего в различные временные периоды начиная с XII века, а также о структуре микробных сообществ мерзлых мумий представителей мамонтовой фауны, включая наличие культивируемых потенциально патогенных бактерий. На основании анализа последовательностей генов «хромосомного ядра» и мобильных генов будет получена информация о направлении и скорости эволюции геномов разнообразных групп патогенных микроорганизмов, осуществлен поиск представителей ранее неохарактеризованных эволюционных линий. Полученные данные могут быть использованы при реконструкции эволюционной истории и филогеографии возбудителей инфекционных заболеваний, включая возбудителей инфекций, отнесенных к числу особо опасных.
17. Начало проекта 01.01.2018
18. Завершение проекта 31.12.2020