Информация о проекте

1. Наименование проекта Универсальные геномные механизмы формирования дискретных фенотипов гольцов на примере мальмы Salvelinus malma в р. Камчатка и оз. Кроноцкое
2. Регистрационный номер ЦИТИС: 124050600014-3
3. Исполнитель Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН
4. Ведомственная принадлежность Минобрнауки России - наука
5. Заказчик РНФ
6. Вид финансирования грант
7. Вид НИОКТР Фундаментальная НИР
8. Приоритетное направление (основное) Нет данных
9. Приоритетное направление (дополнительное) Нет данных
10. Критическая технология (основная) Нет данных
11. Критическая технология (дополнительная) Нет данных
12. Приоритет Стратегии НТР России Переход к высокопродуктивному и экологически чистому агро- и аквахозяйству, разработку и внедрение систем рационального применения средств химической и биологической защиты сельскохозяйственных растений и животных, хранение и эффективную переработку сельскохозяйственной продукции, создание безопасных и качественных, в том числе функциональных, продуктов питания
13. Общее тематическое направление Науки о жизни
14. Приоритетное арктическое направление (основное) Арктическая биология и биотехнологии
15. Приоритетное арктическое направление (дополнительное) Нет
16. Аннотация Лососевые рыбы – ключевой элемент пресноводной ихтиофауны арктических регионов, являются объектом промысла и аквакультуры. Одна из особенностей, позволяющих лососевым рыбам занимать главенствующую роль в северных широтах, – чрезвычайно экологическая пластичность, которая проявляется точечной подстройкой фенотипа под конкретные условия. В некоторых случаях адаптации выходят за границы нормы реакции вида и закрепляются в дискретных фенотипах. Процесс дивергенции новых форм из единого предка называется адаптивной радиацией. Этот феномен чаще всего встречается у озёрных гольцов рода Salvelinus, более чем в 70 озёрах популяционная система разделяется на пары форм: планктоноядную (или рыбоядную) и бентосоядную. При этом экологические зоны и варианты адаптаций, судя по всему, однотипны по всему ареалу. Эта особенность предполагает наличие универсальных геномных механизмов, приводящих к формированию новых фенотипов, однако работ, посвящённых этой тематике, практически нет. Среди лососевых рыб только для мальмоидных гольцов (Salvelinus cf. malma) известны примеры репродуктивно изолированных форм в речных экосистемах – это каменный и белый гольцы, обитающие в бассейне р. Камчатка. При этом в бассейне р. Камчатка ранее были описаны ручьевые группировки в р. Урц, р. Николка, ручье Пономарский (Савваитова, 1989), которые значительно отличаются от проходной мальмы числом пилорических придатков, позвонков и жаберных тычинок. После первоописания работ по этим гольцам не проводилось. Более того были обнаружены сходные формы в других водотоках. Подтверждение репродуктивной изоляции между локальными группировками и проходной мальмой, повсеместно встречающейся в бассейне р. Камчатка, будет означать наличие нетипичных для лососевых рыб механизмов формирования локального разнообразия. Одним из основных методов выполнения проекта станет ddRAD-seq (double digest RAD sequencing) – высокопроизводительное секвенирование, с высоким разрешением. Результатом работы ddRAD-seq являются миллионы коротких последовательностей, соответствующих участкам генома, находящимся рядом с рестрикционными сайтами. Эти данные могут быть использованы для идентификации полиморфизмов и изучения генетических механизмов, лежащих в основе фенотипических различий между организмами. Более того в рамках предлагаемого проекта будет проведена уникальная работа по оценке параллельности микроэволюционных процессов, происходящих в речных и озёрных экосистемах. Объектом исследования станут рыбоядные гольцы двух крупнейших пресноводных экосистем Камчатки – оз. Кроноцкое и р. Камчатка. Планируется сравнить геномный полиморфизм, отличающий рыбоядных гольцов от общего предка, выявить сходства и различия в озёрных речных экосистемах. Наиболее вероятно, будут обнаружены параллелизмы в мутациях локусов, отвечающих за: 1) формирование краниофациальной области; 2) регуляцию липидного обмена 3) регуляцию активности тиреоидной оси. Для проверки поставленных гипотез будут проведены работы по всему бассейну р. Камчатка, уже намечены участки малых водотоков, подобные р. Озерная. В ходе работ планируется описать морфологические, экологические и генетические особенности каждой из обнаруженных популяций. Для проведения работ по оценке геномных механизмов формирования адаптаций в речных и озёрных экосистемах планируется использовать как собственный материал, так и данные, депонированные в лаборатории Экологии низших позвоночных ИПЭЭ РАН. Осуществимость поставленных задач определяется: 1) наличием у руководителя более 30% необходимого материала; 2) детально проработанной техникой полевых работ, позволяющей получать материал необходимого объёма в труднодоступных регионах; 3) опытом в проведении молекулярно-генетического и морфологического анализов; 4) наличием коллаборации с ведущими биоинформатиками в области эволюционной экологии.
17. Начало проекта 08.08.2023
18. Завершение проекта 30.06.2025